Ukończył Akademię Muzyczną im. K. Lipińskiego we Wrocławiu w klasie prof. Marka Pijarowskiego. Obecnie jest pierwszym dyrygentem Orquesta Sinfónica de Tenerife oraz pierwszym dyrygentem gościnnym Sinfonieorchester Basel. Jest ceniony na całym świecie za pełne dynamiki wykonania i elokwentne interpretacje repertuaru symfonicznego.
W sezonie 2016/2017 zadebiutuje z Koninklijk Concertgebouworkest, a także po raz pierwszy wystąpi w Berlinie i Wiedniu (odpowiednio z Konzerthausorchester i Tonkünstler-Orchester Niederösterreich). Artysta będzie kontynuować współpracę z Residentie Orkest, Bilbao Orkestra Sinfonikoa, Orchestre National de Lille, Filharmonią Łódzką im. A. Rubinsteina, Real Filharmonia de Galicia oraz Orquesta Sinfónica de Navarra. Inne orkiestry, z którymi regularnie występuje, to m.in. NDR Elbphilharmonie Orchester, Orquestra Simfònica de Barcelona, Royal Philharmonic Orchestra, Orchestre Philharmonique de Nice i Orquesta Ciudad de Granada.
Michał Nesterowicz w 2008 r. wygrał Cadaqués Orchestra European Conducting Competition, był też jednym z laureatów 6. Międzynarodowego Konkursu Dyrygentów im. Grzegorza Fitelberga w Katowicach.