Sebastian Hübner studiował na uniwersytetach muzycznych w Stuttgarcie i Mannheim u Georga Jeldena, Alejandra Ramireza, Gerda Türka i Albrechta Ostertaga. W 1996 roku rozpoczął swą międzynarodową karierę, występując w interpretacjach wielkich oratoriów barokowych. Zasłynął jako wykonawca muzyki barokowej i współczesnej. Ostatnio wykonywał partię Ewangelisty w Oratorium na Boże Narodzenie Bacha w Pekinie i w Palermo, w tym roku śpiewa tę samą partię w Hamburgu, Zurychu i Londynie. Artysta występuje we współczesnych operach Luigiego Nono, Heinera Goebbelsa i Arnulfa Hermanna podczas Berliner Festspiele, w Mannheim Nationaltheater, Oper Frankfurt oraz podczas Biennale Munich. Jako członek zespołu Schola Heidelberg i jako solista śpiewał w wielu światowych prawykonaniach podczas renomowanych festiwali, takich jak m.in. Flandern Festival, Ultraschall Berlin, Wittener Tage für Neue Kammermusik. Sebastian Hübner jest wykładowcą Heidelberger Hochschule für Kirchenmusik oraz Uniwersytetu Muzycznego we Frankfurcie. Ma trzech synów i mieszka w Heidelbergu.