Jazz at Lincoln Center Orchestra to niezwykle wszechstronna grupa. Pod przewodnictwem Wyntona Marsalisa, dyrektora zarządzającego i artystycznego w Jazz at Lincoln Center, wykonuje szeroki repertuar: począwszy od autorskich kompozycji i utworów jazzowych powstałych na zlecenie Lincoln Center, skończywszy na niespotykanych, historycznych kompozycjach i arcydziełach artystów, takich jak Duke Ellington, Count Basie, Fletcher Henderson, Thelonious Monk, Mary Lou Williams, Dizzy Gillespie, Benny Goodman i Charles Mingus.
W skład grupy Jazz at Lincoln Center Orchestra with Wynton Marsalis wchodzi piętnastu najlepszych współczesnych solistów i członków zespołów jazzowych. JLCO, rezydująca w Jazz at Lincoln Center od 1988 roku, występuje i prowadzi wydarzenia edukacyjne w Nowym Jorku, na terenie Stanów Zjednoczonych i na całym świecie. W ramach licznych tras koncertowych muzycy odwiedzili ponad trzysta miast na sześciu kontynentach, często towarzysząc orkiestrom symfonicznym, zespołom baletowym, uczniom i licznym zaproszonym artystom. W roli dyrygentów gościnnych zespołu występowali Benny Carter, John Lewis, Jimmy Heath, Chico O’Farrill, Ray Santos, Paquito D’Rivera, Jon Faddis, Robert Sadin, David Berger, Gerald Wilson i Loren Schoenberg. JLCO przez cztery lata z rzędu (2013–2016) wybierano na najlepszy Big Band w dorocznym plebiscycie czytelników „DownBeat”.
W 2015 roku Jazz w Lincoln Center uruchomił wytwórnię Blue Engine Records, która ma za zadanie udostępniać miłośnikom jazzu na całym świecie archiwalne nagrania koncertowe. Koncert wydany na pierwszym albumie tej wytwórni, Live in Cuba, został nagrany podczas historycznej podróży JLCO do Hawany w 2010 i ukazał się w październiku 2015 roku. Album Big Band Holidays ukazał się w grudniu 2015, The Abyssinian Mass – w marcu 2016, a The Music of John Lewis – w marcu 2017 roku. Handful of Keys, zrealizowany z grupą gwiazd pianistyki, wydano we wrześniu 2017 roku.
Za stroje muzyków Jazz at Lincoln Center Orchestra with Wynton Marsalis odpowiada Brooks Brothers, oficjalny partner zespołu.