Jan Krejča zaczynał od gry na lutni renesansowej, by następnie poszerzyć swoje zainteresowania o teorbę i gitarę barokową. Obecnie daje recitale solowe, a jako ceniony wykonawca partii basso continuo występuje z wieloma zespołami czeskimi i zagranicznymi (m.in. Collegium 1704, Collegium Marianum, Ensemble Tourbillon, Ensemble Inégal, Capella Cracoviensis, Capella Anna, Les Traversée Baroque). Regularnie występuje na festiwalach, takich jak Praska Wiosna, Praska Jesień, Concentus Moraviae, Festiwal św. Wacława oraz Early Music Summer Festival. Brał udział w wielu cieszących się uznaniem krytyki nagraniach, w tym własnego albumu solowego Intavolatura di Tiorba.